在过去的700万年里,我们的大脑扩张到了以前的三倍,长成了容积1.5L的巨大器官。数个人类特有的基因都与该变化有关,而其中三个,是某种意义上的“三胞胎”。上月末发表在《细胞》(Cell)上的两篇论文,阐释了它们推动大脑膨胀的分子机制和进化历程[1][2]。
一直以来,人们认为它们是一个而非三个基因。因为最初DNA测序技术不完善,最早发现的不是基因的DNA序列,而是由它们编码的蛋白产物。这些蛋白产物基本长得一样,并不能让人想到基因组里还有三段编码它的DNA序列。由于它与细胞膜上的一个有名受体NOTCH非常相像,而被命名为NOTCH2NL,意思是“类似NOTCH2蛋白N端的片段”。
不久之后,人们发现该基因为灵长类所特有,而且只在人类中活跃表达。
NOTCH在神经系统中为人熟知的功能之一,是维持祖细胞的自我更新能力,防止其分化为不再分裂增生的神经细胞或其它终末细胞。由于NOTCH2NL与NOTCH的相似性,一个自然的联想是,前者是否会增强后者的功能,让更多祖细胞分裂增生,产生更多神经元?
的确,马普所分子细胞和遗传研究所的维兰德·胡特纳(Wieland Huttner)发现该基因活跃于胚胎大脑之后,将人类的NOTCH2NL塞进了小鼠胚胎,看到神经祖细胞的分化被延迟了,数量增多了,结果汇报在了今年3月出版的《eLife》上。
同样的结果在体外培养的人类干细胞上得到了验证。比利时布鲁塞尔自由大学的神经发育学家皮埃尔·范德哈根(Pierre Vanderhaeghen)在他的《细胞》论文中报道:在NOTCH2NL本该较不活跃的发育早期抬高了它的表达量,确实得到了更多细胞。
范德哈根还探索了NOTCH2NL是如何通过增强NOTCH信号来做到这一点的。NOTCH信号通路有一个神奇的性质:来自邻近细胞的信号分子可以激活它,而自己细胞的信号分子却会抑制自己的NOTCH(考虑到该信号分子是固定在细胞膜上的,这种相反的效果可能和它与NOTCH结合时的相反方向有关,想象一下像蜘蛛侠一样倒挂着接吻好了)。不管怎样,由于NOTCH2NL也可以与该信号分子结合,它减弱了后者对自家NOTCH的抑制,从而激活了NOTCH,促进了神经祖细胞的增生,最终产生了更多了神经细胞。
范德哈根的数据证实了NOTCH2NL与该信号分子的相互作用和它对NOTCH信号产生的效果,“非常有说服力的生物学数据,”耶鲁大学的进化遗传学家詹姆斯·努南(James Noonan)评论道,“在之前涉及人类进化的基因研究中,人们发现划出从基因差异到表型、再到生物化学的机制的联系并不容易。”
由于最早只发现了蛋白产物,而且三兄弟如此相像,导致基因组数据拼接错误,人们一直并没有搞清楚编码NOTCH2NL的是什么是什么基因。这次,范德哈根和生物信息学家戴维·豪斯勒(David Haussler)及其合作者各自用了不同的方法,鉴定出了编码它们的三个同源基因(NOTCH2NLA,NOTCH2NLB和NOTCH2NLC),准确地说是四个同源片段,只不过最后一个是没有功能的假基因(pseudogene)。
利用人类、黑猩猩和大猩猩的基因组数据,他得以重构NOTCH2NL在灵长类中的进化历程:在一千四百万年前,大猿的共同祖先的一个NOTCH基因被错误的复制了一部分,成为了基因组中的一个不完整、无功能的假基因。这个假基因在大猩猩和黑猩猩中继续存在,期间又被错误复制了几轮,各自产生了总共3个和8个假基因;而在人类的共同祖先那里,三四百万年前,在人类大脑体积膨胀前不久,NOTCH2NL意外获得了功能并充分表达,之后又经历了两轮错误复制(是的猿类基因组的这一块区域就是那么容易错误复制),产生了三个NOTCH2NL基因和一个假基因。
看到这里你大概在想,再多几个NOTCH2NL拷贝、再多激活NOTCH信号、再多一点神经祖细胞,是不是会让你的孩子脑子更大、智商更高?
很不幸地告诉你,前者或许成立,后者可不一定对。有一类神经发育疾病叫做“1号染色体长臂2区1带1子带远端删除/重复综合征(1q21.1 distal deletion/duplication syndrome)”,它的症状包括小头症、巨头症、精神分裂症或自闭症。之前由于基因组数据拼接错误,很少有人考虑NOTCH2NL在该疾病中发挥的作用。根据豪斯勒的报道,它与那些症状是相关的。
杜克大学的进化发育生物学家格雷格·雷(Greg Wray)认为该基因与脑疾病的关联相当有说服力,“这些基因很有可能在大脑皮层发育中发挥重要错误,而错误的调控则导致疾病,”他说。不过他并不完全相信它们在人类进化中的作用,因为NOTCH2NL所在的基因组区域实在是太复杂多变了,多个重复片段加大了测序难度。并且,从人类和其它物种的基因数据中推断进化过程中的功能差异,证据并不直接。
豪斯勒却认为这些基因在人类大脑进化中发挥的作用将会得到印证。“一个基因的改变当然不一定能推动大脑体积的膨胀,但总有几个基因发挥的是根本性的作用。”他说。
本文主要参考自《科学》(Science)杂志网站新闻《基因三重奏驱动人类大脑进化》(Trio of genes supercharged human brain evolution),作者Elizabeth Pennisi,该文亦以标题《旧基因的新拷贝推动大脑膨胀》(New copies of old gene drove brain expansion)出现在杂志纸刊上。NOTCH2NL在本月有了自己的维基百科页面,你可以在这上面了解更多。